PENAMBATAN MOLEKUL SENYAWA METABOLIT BAKTERI LACTOBACILLUS DAN PEDIOCOCCUS TERHADAP PROTEIN 3CL PROTEASE SARS-COV-2

No.780 COVID-19 merupakan salah satu penyakit infeksi pernapasan menular yang disebabkan oleh virus SARS-CoV-2. 3CL protease merupakan salah satu struktur dari virus SARS-CoV-2 yang memiliki peran dalam replikasi perbanyakan virus. Bakteri Asam Laktat (BAL) dapat memproduksi metabolit seperti asam laktat, hidrogen proksida, dan bakteriosin yang telah dipelajari kemampuannya untuk menurunkan aktivitas virus. Tujuan penelitian ini adalah untuk memperoleh kandidat senyawa potensial yang dapat berinteraksi dengan protein 3CL protease dengan metode penambatan molekul menggunakan perangkat lunak Autodock Vina, PLANTS, dan Molegro Virtual Docker. Berdasarkan hasil penambatan tersebut didapatkan 10 kandiat senyawa metabolit bakteri Lactobacillus dan Pediococcus yang mempunyai potensi sebagai antivirus SARS-CoV-2 yaitu Asam Tetradekanoat, Asam Heksadekanoat, Tetradekana, Heksadekana, Asam Dodekanoat, (Z)-9-Oktadekenamida, Dodekana, Heptil Hidroperoksida, Asam Eikosanoat, dan Undekana. Namun hasil penambatan molekul dengan menggunakan tiga perangkat lunak tersebut masih memiliki aktivitas yang lebih rendah dibandingkan dengan senyawa pembanding Lopinavir. Berdasarkan hasil analisis visualisasi hasil penambatan, senyawa tersebut menunjukan adanya interaksi terhadap asam amino protein 3CL protease SARS-CoV-2. Hasil analisis Lipinski’s Rule of Five serta analisis toksisitas menunjukan bahwa senyawa uji sudah masuk kriteria obat oral dan tidak bersifat toksik maupun karsinogenik